société française de biotechnologie WhiteLab Génomique a levé 10 millions de dollars pour financer une plateforme d’IA conçue pour aider à la découverte et au développement de thérapies génomiques.
Fondée à Paris en 2019, WhiteLab Genomics, récemment diplômé de Y Combinator (YC), fournit aux entreprises de thérapie génique et cellulaire des simulations logicielles prédictives pour accélérer la conception de thérapies géniques et cellulaires. La thérapie génique, pour les non-initiés, est un traitement émergent qui consiste à remplacer les gènes manquants ou défectueux dans les cellules pour corriger les troubles génétiques, tandis que la thérapie cellulaire consiste à modifier une cellule ou des ensembles de cellules pour déclencher un effet dans tout le corps.
Des milliers de maladies, dont la fibrose kystique, la maladie de Parkinson et la maladie d’Alzheimer, découlent de défauts dans l’ADN d’un individu, et la recherche émergente sur les thérapies géniques et cellulaires pourrait éventuellement traiter ces affections à leur source, supplantant le besoin de médicaments ou de chirurgie.
Cependant, de telles thérapies sont généralement coûteuses à développer sans aucune garantie qu’elles fonctionneront. Selon le PDG et cofondateur de WhiteLab Genomics, David Del Bourgo, les méthodologies actuelles de développement de nouvelles thérapies géniques et cellulaires impliquent généralement une approche par essais et erreurs, selon laquelle les scientifiques formulent une hypothèse scientifique et la testent en laboratoire : en cas de succès, elle évolue vers l’étape suivante, mais en cas d’échec, ils retournent à la case départ avec une hypothèse différente. Et c’est là que WhiteLab Genomics entre dans la mêlée, avec une approche informatique qui associe des techniques d’apprentissage automatique et d’apprentissage en profondeur pour traiter plusieurs hypothèses scientifiques à la fois, en examinant différentes variantes génétiques « pour prédire la meilleure conception moléculaire pour la thérapie » en fonction des objectifs. .
« Les thérapies géniques et cellulaires souffrent toujours d’une faible efficacité, d’effets secondaires immunologiques et d’un coût de développement très élevé », a expliqué Del Bourgo à TechCrunch. « Nous fournissons à nos clients des modèles prédictifs exhaustifs combinant génétique et biologie computationnelle afin de concevoir et sélectionner les meilleurs candidats à tester en laboratoire. »
Fondateurs de WhiteLab Genomics : le PDG David Del Bourogo et le directeur scientifique Julien Cottineau Crédits image: WhiteLab Genomics
Montrez-moi les données
Comme pour à peu près tous les modèles d’IA, WhiteLab Genomics utilise une myriade d’ensembles de données pour former ses algorithmes couvrant des référentiels génomiques, ARN, oncologiques et protéiques, en plus d’un « ensemble exhaustif de documentation » tels que des données de recherche scientifique et clinique publiques.
« Nous nous associons également à des institutions spécialisées pour enrichir les modèles avec des données supplémentaires non publiques », a ajouté Del Bourgo. « Nous entraînons et validons nos algorithmes sur des ensembles de données bien caractérisés qui sont interconnectés au sein de notre base de données Knowledge Graph. Celles-ci comprenaient des bases de données publiques, des données exclusives et des ensembles de données de nos partenaires. Il prédit les caractéristiques biologiques de nouvelles séquences génétiques pour construire de nouveaux vecteurs thérapeutiques et générer de nouvelles constructions thérapeutiques.
En ce qui concerne les types de traitements que WhiteLab Genomics aide à développer, Del Bourgo a déclaré que la société travaille actuellement sur des projets comprenant des thérapies à base d’ADN pour des conditions métaboliques telles que maladies lysosomalesainsi que des thérapies cellulaires souches pour les maladies du sang telles que drépanocytose et les thérapies immuno-géniques pour traiter les cancers.
Ailleurs, un certain nombre d’entreprises utilisent l’IA pour faciliter la découverte de médicaments, comme BenevolentAI qui a levé des investissements importants du monde du VCtandis qu’il y a le gagnant du champ de bataille de démarrage de TechCrunch Cellino qui a récemment levé 80 millions de dollars pour développer des thérapies cellulaires utilisant l’IA. WhiteLab Genomics est similaire, mais il fonctionne avec les deux gènes et sociétés de thérapie cellulaire.
Il convient également de noter que WhiteLab Genomics représente une liste croissante de startups françaises pour infiltrer avec succès les rangs du YC. Sur les 40 entreprises européennes de la cohorte Winter ’22 de WhiteLab Genomics, 5 étaient françaises, un chiffre qui est passé à 8 contre 34 pour la tranche Summer ’22 – le deuxième plus grand nombre de toute l’Europe.
Avec 10 millions de dollars en banque d’un investisseur français Omnes Capitale et poids lourds biopharmaceutiques Débiopharm, WhiteLab Genomics est maintenant bien financé pour développer sa plate-forme et doubler ses partenariats avec le monde scientifique, qui a jusqu’à présent inclus des collaborations notables avec l’Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale (Institut National de la Santé et de la Recherche Médicale)Inserm), Laboratoires Généthonparmi d’autres sociétés pharmaceutiques et biotechnologiques.
